Deportes Quindio U20

Höhepunkt der Vereinsgeschichte war der Gewinn der Kolumbianischen Meisterschaft 1956. Deportes Quindio nahm in zwei Spielzeiten an der Copa Conmebol teil. Während dort 1999 das Aus bereits in der ersten Runde kam, erreichte der Klub 1998 das Viertelfinale des Wettbewerbs. 2000 stieg Deportes Quindío in die zweite Liga ab, konnte aber 2001 direkt wieder aufsteigen.

2004 beendete der 101-fache Nationalspieler Leonel Álvarez seine Laufbahn bei Deportes Quindío.

2013 stieg der Verein zum zweiten Mal aus der ersten Liga ab und spielte ab der Saison 2014 in der Categoría Primera B. In der Hinserie erreichte der Verein das Viertelfinale, schied dort aber gegen América de Cali aus. Die Rückserie konnte Quindío gewinnen, verlor aber das Finale um den Aufstieg gegen Jaguares de Córdoba und konnte sich auch in der Relegation gegen Uniautónoma FC nicht durchsetzen. Auch in der besonderen Aufstiegsrunde für Traditionsvereine der zweiten Liga im Januar 2015 konnte der Verein nicht aufsteigen. In der Spielzeit 2015 verfehlte der Verein dann nur um zwei Punkte den Einzug in die Finalrunde und beendete die Saison auf dem neunten Platz.

In der Spielzeit 2016 verfehlte Deportes Quindío den Aufstieg nur knapp durch eine Niederlage im letzten Spiel der Finalrunde gegen América de Cali.

Für die Spielzeit 2017 wurde José Alberto Suárez als neuer Trainer vorgestellt. Unter ihm wurde Deportes Quindío Zweiter der Ligaphase und erreichte das Halbfinale der Finalrunde. In der Rückserie wurde Quindío Dritter der Ligaphase, verlor aber dann im Viertelfinale sehr deutlich (mit 0:5 und 1:3) gegen Llaneros FC.

In der Spielzeit 2018 konnte sich Quindío als Sechster für die Finalrunde qualifizieren und musste sich dort nur Unión Magdalena geschlagen geben. In der Apertura 2019 erreichte der Verein als Zweiter die Finalrunde, wurde in der Gruppenphase jedoch nur Dritter.