Cortulua U20

Der Verein schaffte 1993 das erste Mal den Aufstieg in die Categoría Primera A. Der erste Platz in der Hinserie 2001 war bislang der größte Erfolg, der an der Teilnahme der Copa Libertadores 2002 berechtigte. 2004 stieg der Verein allerdings in die Categoría Primera B ab. Cortuluá stieg 2009 wieder in die erste Liga auf, konnte sich da aber nur ein Jahr halten und spielte danach wieder in der zweiten Liga. In den Spielzeiten 2011 bis 2013 konnte der Verein sich regelmäßig für die Gruppenphase qualifizieren, ohne aber ein Finale erreichen zu können. In beiden Halbserien 2014 verpasste der Verein allerdings den Einzug in die Finalrunde und konnte somit nicht um den Aufstieg mitspielen.

Als Traditionsverein erhielt Cortuluá im Januar 2015 die Möglichkeit, an einer gesonderten Aufstiegsrunde teilzunehmen. Dort konnte sich der Verein in seiner Gruppe durchsetzen und spielt somit ab 2015 wieder in der ersten Liga.

In der ersten Saison in der ersten Liga landete der Verein in beiden Halbserien im Mittelfeld der Tabelle und konnte damit erfolgreich den direkten Wiederabstieg verhindern, jedoch auch nicht um den Einzug in die Finalrunden mitspielen.

In der Hinserie der Spielzeit 2016 konnte Cortulá das Halbfinale erreichen, wo es gegen den späteren Meister Independiente Medellín ausschied. Zudem stellte der Verein mit Miguel Borja den Torschützenkönig. In der Rückserie konnte Cortuluá diese Leistung auch auf Grund vieler Weggänge von Spielern nicht bestätigen und beendete die Saison auf den hinteren Tabellenplätzen. Auch die Hinserie 2017 konnte Cortuluá nicht besser gestalten und beendete die Ligaphase auf dem letzten Tabellenplatz. Der langjährige Trainer Jaime de la Pava entschied sich, seinen Vertrag nicht zu verlängern, weswegen im Juni 2017 Néstor Otero als Nachfolger verpflichtet wurde. In der Rückserie konnte sich Cortuluá nicht von der schwachen Hinserie erholen und stieg am letzten Spieltag aufgrund eines Gegentors in der letzten Minute gegen Once Caldas in die zweite Liga ab.

Als neuer Trainer für die Spielzeit 2018 wurde Álvaro Hernández vorgestellt. Cortuluá konnte sich als Fünfter für die Finalrunde qualifizieren und musste sich dort als Gruppenzweiter nur Cúcuta Deportivo geschlagen geben. Im März 2019 trat Hernández als Trainer zurück. Zu seinem Nachfolger wurde der bisherige Spieler Mayer Candelo. Candelo erreichte mit Cortuluá direkt das Finale der Apertura 2019. Die Mannschaft unterlag im Finale aber im Elfmeterschießen gegen Deportivo Pereira.