Panathinaikos U20 ist eine griechische Fußballmannschaft, die in der Super League 2, der zweiten Liga des griechischen Fußballsystems, spielt. Sie ist die Reservemannschaft des Vereins Panathinaikos FC.

Die Mannschaft wurde 1937 gegründet und gewann seitdem dreimal den griechischen U20-Pokal. Sie spielt ihre Heimspiele im Apostolos Nikolaidis Stadium in Athen.

Panathinaikos U20 ist eine der erfolgreichsten U20-Mannschaften in Griechenland und hat viele Spieler hervorgebracht, die für die griechische Nationalmannschaft gespielt haben. Zu den bekanntesten Spielern, die aus der Jugendakademie von Panathinaikos hervorgegangen sind, gehören Kostas Katsouranis, Giorgos Karagounis und Dimitris Salpingidis.

Die Mannschaft wird derzeit von Giannis Vonortas trainiert.