Der Cuiaba EC U20 ist ein brasilianischer Fußballverein aus Cuiabá, dem Bundesstaat Mato Grosso. Er ist die Jugendabteilung des Cuiabá EC und wurde 2001 gegründet. Das Team spielt in der brasilianischen U20-Meisterschaft und in der U20-Staatsmeisterschaft von Mato Grosso.
Die Heimspiele des Cuiaba EC U20 werden im Estádio Eurico Gaspar Dutra ausgetragen, das 16.000 Zuschauern Platz bietet. Das Stadion wurde 1976 erbaut und ist nach dem ehemaligen brasilianischen Präsidenten Eurico Gaspar Dutra benannt.
Die größten Erfolge des Cuiaba EC U20 sind der Gewinn der U20-Staatsmeisterschaft von Mato Grosso in den Jahren 2004, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, 2014, 2015 und 2016. In der brasilianischen U20-Meisterschaft erreichte das Team 2016 das Halbfinale.
Der Cuiaba EC U20 ist ein erfolgreicher Verein, der einige der besten Nachwuchsspieler Brasiliens hervorgebracht hat. Viele ehemalige Spieler des Teams sind in die brasilianische Nationalmannschaft berufen worden, darunter Thiago Silva, David Luiz, Fernandinho und Roberto Firmino.